pent 用于估计Copula熵的R包 介绍 Copula熵是用于统计独立性度量的数学概念[1]。在双变量情况下,Copula熵被证明等同于互信息。与Pearson相关系数不同,Copula熵是为非线性,高阶和多元情况定义的,这使其普遍适用。 它具有广泛的应用,包括但不限于: 结构学习; 变量选择[2]; 因果发现(估计转移熵)[3]。 该算法包括两个步骤:使用秩统计量估计经验语料密度,以及使用kNN方法从估计的经验语料密度中估计语料熵。由于两个步骤都使用非参数方法,因此可以将copent算法应用于任何情况而无需进行假设。 在copent包的预印纸上的arXiv。有关更多信息,请参阅[1-3]。有关中文的更多信息,请点击。 功能 copent-主要功能; Construct_empirical_copula-算法的第一步,它通过秩统计来估计数据的经验copula; entknn-算法的
2021-10-19 14:58:00 7KB correlation entropy variable-selection copula
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ukbtools 使用随附的[UKB程序]( )下载并解密UK Biobank(UKB)数据后,您需要将多个文件汇集在一起​​,为您提供了一个可探索的数据集。 数据文件具有列名,这些列名是中编辑的字段代码。 ukbtools可以轻松地将多个UKB文件折叠到单个数据集中以进行分析,在此过程中,将为变量赋予有意义的名称。 该软件包还包括以下功能:检索ICD诊断,在UKB样本的背景下探索样本子集以及收集遗传元数据。 安装 # Install from CRAN install.packages( " ukbtools " ) # Install latest development version devtools :: install_github( " kenhanscombe/ukbtools " , dependencies = TRUE ) 先决条件:制作UKB文件集 下载§,然
2021-10-12 15:12:38 3.49MB r biobank ukb uk-biobank
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目的 r3PG提供了“预测生长的生理过程”( )模型的实现(Landsberg&Waring,1997),该模型可模拟森林的生长和生产力。 r3PG是用Fortran编写的3-PGpjs (Sands,2010)和3-PGmix (Forrester&Tang,2016)模型的灵活易用的界面。 该软件包可实现与模型的快速,轻松交互,并且Fortran重新实现可促进计算密集型灵敏度分析和校准。 用户可以灵活地在各种选项和子模块之间切换,以将原始的3-PGpjs模型版本用于单特异性,平均年龄和常绿森林,以及3-PGmix模型,该模型还可以模拟多队列林分(例如,混合,不均匀,的),其中含有落叶树种。 用法 以下是一个基本示例,有关更多扩展示例,请访问package 。 主要功能是run_3PG() ,它按月时间步长返回4种数组或长格式数据帧的每个物种的所有108个模拟变量。 librar
2021-09-30 10:21:36 63.49MB HTML
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brms 概述 brms程序包提供了一个接口,以使用Stan来拟合贝叶斯广义(非)线性多元多级模型,这是一个用于执行完整贝叶斯推理的C ++程序包(请参见 )。 公式语法与软件包lme4的语法非常相似,以提供用于执行回归分析的熟悉且简单的界面。 支持广泛的响应分布,使用户可以在多级上下文中拟合线性,鲁棒线性,计数数据,生存时间,响应时间,序数,零膨胀甚至自定义混合模型等。 进一步的建模选项包括非线性和平滑项,自相关结构,检查数据,缺失值插补等。 另外,可以预测响应分布的所有参数,以执行分布回归。 多变量模型(即具有多个响应变量的模型)也可以拟合。 先前的规范是灵活的,并且明确鼓励用户使用实际上反映其信念的先前发行版。 可以轻松评估模型拟合度,并将其与后验预测检查,交叉验证和贝叶斯因素进行比较。 资源 (统计软件期刊) (R Journal) (具有文档和小插曲的brms网站) (有关
2021-09-26 16:18:48 4.29MB multilevel-models bayesian-inference stan brms
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mfGARCH-混频GARCH模型 用于估计GARCH-MIDAS(混合DAta采样)模型的R包(Engle,Ghysels和Sohn,2013年, )和相关的统计推断,随附论文“两个比一个更好:使用乘法的波动率预测组件GARCH模型”(康拉德和克莱恩(2020, )。 GARCH-MIDAS模型将(每日)股票收益率的条件方差分解为短期和长期成分,后者可能取决于以较低频率采样的外生协变量。 强调 使用GARCH-MIDAS模型进行估算和预测的综合工具箱 易于使用,带有一个或两个解释协变量 专为处理不规则间隔的混频数据而设计 请引用为 康拉德,克里斯蒂安和克莱恩,昂诺(2020)。 有两个比一个要好:使用乘性分量GARCH-MIDAS模型进行的波动率预测。 Journal of Applied Econometrics 35:19–45。 和 克莱恩·昂诺(2020)。 mfGARCH
2021-09-07 11:59:52 30.38MB R
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smapr:R包,用于获取和处理NASA SMAP数据
2021-08-30 21:05:51 1.55MB r nasa raster rstats
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pm "plspm"是一个软件包,专用于对度量和非度量数据进行偏最小二乘路径建模(PLS-PM)分析。 高于4.0的版本包含一组全新的功能来处理非度量变量。 捐款 如果您在plspm发现任何价值和实用性,请考虑一次性捐款。 您的支持确实很重要。 安装 您可以使用软件包"devtools"的功能install_github()安装"plspm" "devtools" # install "devtools" install . packages ( "devtools" ) library ( devtools ) # install "plspm" install_github ( "gastonstat/plspm" ) 具有指标数据的PLS-PM 客户满意度模型的典型示例 # load plspm library ( plspm ) # load dataset satisfa
2021-08-24 12:45:27 231KB R
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Matlab集成的c代码散粒噪声 R套件,用于精确模拟非负散粒噪声过程(具有伯努利,泊松,伽玛和高斯分布逆跳)和非高斯OU过程,也称为Lévy驱动的OU过程(特别是OU-Poisson,论文中的OU-Gamma和OU逆高斯(OU-IG)过程) [1] M. Tamborrino,P。Lansky,散粒噪声,弱收敛和扩散近似,Physica D,418,132845,2021, 该代码由Rcpp中的Massimiliano Tamborrino(warwick.ac.uk上的名字点secondname)编写。 Yan Qu为基于论文的OU-Gamma和OU-IG过程提供了Matlab代码,用于精确模拟OU-Gamma和OU-IG过程 [2] Y. Qu,A。Dassios,H。Zhao,伽马驱动的Ornstein–Uhlenbeck过程具有有限和无限活动跃迁的精确模拟,J。Oper。 Res。 Soc。,471--484,2019,。 [3] Y. Qu,A. Dassios,H. Zhao,Ornstein–Uhlenbeck回火稳定过程的精确模拟,J. Appl。Chem。,117,
2021-08-23 17:13:02 92KB 系统开源
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伤心 R包,用于拟合物种丰度分布 保罗·普拉多(Paulo I. Prado),穆里洛·米兰达(Murilo Miranda)和安德烈·查洛姆(Andre Chalom) 安装 install.packages( ' sads ' ) library( sads ) 或从下载二进制文件。 开发者版本 GitHub上的Master分支具有发布版本,可在CRAN上获得。 如果要安装开发人员版本: library( devtools ) install_github( repo = ' piLaboratory/sads ' , ref = ' dev ' , build_vignettes = TRUE ) 在Windows下运行时,您将需要安装Rtools软件包以在本地构建小插图。 可以通过以下方式安装一个实验分支,该分支实现Lindsey(1999)对连续密度分布的对数似然率的
2021-08-21 15:34:23 180KB R
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bfast算法技术文档
2021-07-17 09:06:12 158KB 共享资源 R包
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