MetaboAnalystR:MetaboAnalyst的R包-源码

MetaboAnalystR 3.0：迈向全球代谢组学的优化工作流程 描述 MetaboAnalystR 3.0包含流行的MetaboAnalyst Web服务器基础的R函数和库，包括代谢组学数据分析，可视化和功能解释。 该软件包与MetaboAnalyst Web服务器同步。 安装和加载软件包后，用户将能够使用从MetaboAnalyst网站下载的相应R命令历史记录从本地计算机上复制相同的结果，从而获得最大的灵活性和可重复性。 3.0版旨在通过实施用于峰选择的快速参数优化算法，并从12种完善的方法中自动识别最适合批效应校正的方法，来改善当前的全局代谢组学工作流程。 此外，添加了更多对通过mummichog2（m / z）峰直接从m / z峰进行功能性解释的支持（PMID：23861661），以及添加了基于路径的集成多组学数据的新方法。 为了演示此新功能，我们提供了“ MetaboAna