互信息计算matlab代码计算聚类之间的调整后的相互信息 该存储库包含用于在R中的聚类之间快速且并行地计算调整后的相互信息(AMI),归一化的相互信息(NMI)和调整后的兰德指数(ARI)的代码。 NMI和ARI被广泛使用并且是成熟的分区协议度量标准。 调整后的相互信息度量标准由提出。 它提供了归一化的互信息度量,可通过计算观察到的群集大小分布的分区之间的预期互信息(EMI)来校正随机预期分区重叠的基线值,从而对其进行校正。 有关更多信息,另请参见。 原始作者提供了计算AMI值和其他功能的信息。 该存储库中的代码提供了AMI,NMI和ARI的快速,高效和可并行计算。 它用于特定的生物学应用:在将微生物宏基因组序列数据聚集成(OTU)时评估分区的一致性。 该存储库中提供的数据是针对〜1M序列的集合,根据完整链接或平均链接聚类,将其聚集成OTU。 两个分区都以每行一行(“ otu映射”)和每行一行(“ seq映射”)的格式保存; R脚本中提供了更多详细信息。 重要的是,该代码是通用的,可用于任何类型的聚类数据。 将序列聚类到OTU中只是一个应用示例。
2021-11-17 09:12:30 10.92MB 系统开源
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通过var模型获得残差的协方差计算,利用乔里斯基方差分解技术进一步将其转换为下三角矩阵,可以用于计算变量间的风险溢出效应
2021-11-16 21:43:58 1KB R代码
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计量经济学案例 计量经济学案例的共享R代码
2021-11-15 15:35:47 21KB R
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关于传染病模型的r语言代码,有需要的同志们分享一下
2021-11-07 15:20:34 3KB sir
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Bayesian Computation R代码 ,非常不错,实用,经测试好用
2021-10-31 16:11:04 23KB Bayesian  R code
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R语言获取沪深股票信息和股指数据,学习R语言的好资料
2021-10-04 19:57:28 349KB R 交易 股票
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利用高斯回归进行数据预测,有实例和注释,可供参考学习
2021-09-28 16:02:42 98KB gmr GMM/GMR 回归 高斯回归
这是一些代码,用于从气候研究部门的网格时间序列数据( (变量pre和tmp ))中提取温度和降水数据。 此存储库中的代码从以下NetCDF文件中提取数据: cru_ts3.22.1901.2013.pre.dat.nc cru_ts3.22.1901.2013.tmp.dat.nc (不包含在仓库中,因为它们每个都接近3 GB)。 然后,它对数据进行子集处理,以匹配“的项目的数据的位置和月份(数据也未包含在回购中,因为它尚未公开)。
2021-09-07 08:24:09 7KB R
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资源有用,希望能够对大家有帮助。好资源大家gongxiang
2021-08-15 18:28:15 844B r语言
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基于聚类分析和多元回归的空气质量的分析的R代码,包含聚类分析代码,因子分析代码,气泡图,柱形图。文章内容发布在我的博客中,希望对大家有所帮助
2021-06-13 21:11:00 443KB 因子分析 聚类分析 R 描述性分析
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